nobuyk さんこんにちは、
XPressME Integration Kit のご利用ありがとうございます。
早速ですが
“wp-content フォルダーが存在します” と 表示されるので、上書されない様にスキップ
の部分、上書きで結構です。
「モジュールの作成」での説明が不十分たったかもしれませんが
XPressME Integration KitはWordPressのwp-content フォルダーに、XPressMEで必要となるプラグインとテーマを追加します。
そんな訳で、エラーの内容の詳細は確認していませんが、再度モジュールを作成いただき、お試しいただけないでしょうか?